El martes 7 de mayo de 2024, el equipo de comunicación de Gustavo Aguilar confirmó su dimisión como gobernador de Manabí, aunque aún no se han revelado las causas detrás de esta decisión ni quién ocupará su lugar. Aguilar había sido designado el 11 de diciembre de 2023 mediante el Decreto Ejecutivo N° 72.

En una entrevista concedida a El Universo en ese mismo mes, mencionó que el objetivo del Gobierno era restablecer la paz y la tranquilidad en la provincia costera. Cabe destacar que Aguilar es un general en servicio pasivo de las Fuerzas Armadas.